Ana Teresa Freitas é Professora Catedrática no Departamento de Engenharia Informática (DEI) do Instituto Superior Técnico (IST), onde desenvolve investigação científica nas áreas dos algoritmos combinatórios, aprendizagem automática, biologia computacional, IA aplicada às tecnologias da saúde e informática na área da saúde.

Atualmente (2025-2026), exerce o cargo de Presidente do DEI, tendo anteriormente ocupado o cargo de Presidente da Assembleia da Escola do IST (2021-2024). Entre 2012 e 2016, foi membro do Conselho Científico do IST e integrou a Comissão Executiva do DEI. No âmbito do departamento, coordenou (2023-2024) a área científica de Metodologia e Tecnologias da Programação (MTP).

Durante a sua carreira de 36 anos no IST, passou as duas primeiras décadas como professora no Departamento de Engenharia Eletrotécnica e de Computadores, realizando investigação em microeletrónica e magneto-óptica. Durante este período, contribuiu para o desenvolvimento do projeto Quickchips, permitindo a criação da primeira sala limpa em Portugal para o fabrico de circuitos integrados no Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores (INESC). Este projeto marcou o início da sua carreira de investigação no INESC há cerca de 38 anos.

Enquanto investigadora no Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores: Investigação e Desenvolvimento em Lisboa (INESC-ID), lidera (2022- ) a linha temática "Life and Health Technology". É ainda (2025- ) membro não executivo do Conselho de Administração do Instituto de Engenharia de Sistemas e Computadores: Microsistemas e Nanotecnologias (INESC MN).

Depois de obter o doutoramento em Engenharia Eletrotécnica e de Computadores, em 2002, decidiu desenvolver investigação nas áreas científicas da bioinformática e da biologia computacional. Em 2002, foi cofundadora do grupo de investigação Knowledge Discovery and Bioinformatics (KDBIO).

Em 2013, aventurou-se na transferência de tecnologia, co-fundando a HeartGenetics, Genetics and Biotechnology SA, uma startup na área da genética e saúde digital. Desempenhou funções de CEO (2013-2022) durante uma década, expandindo as operações na UE e América Latina. Em 2020, o laboratório italiano TOMALAB adquiriu a HeartGenetics. 

Em 2013, concluiu uma formação avançada em gestão e empreendedorismo na Católica Lisbon School of Business & Economics.

A nível europeu, representou Portugal como membro do Conselho de Administração (2010-2016) da European Research Infrastructure for life data, ELIXIR, tendo desempenhado o cargo de Vice-Presidente do Conselho em 2017. Atualmente (2023-2027), é Diretora do nó português da infraestrutura ELIXIR. A nível nacional, é membro do Conselho de Administração e Vice-Presidente da Associação BioData.pt, associação que gere o nó português da infraestrutura ELIXIR.